Avant et pendant la guerre, les deux intrusions de ces dernières années ont été des cas particuliers, isolés : en 1995, Augustus Rookwood fraîchement sorti d'Azkaban avait désactivé les sorts et les mangemorts s'étaient alors terrés dans la pénombre en attendant la venue de Potter, attiré par le Magister pour mettre la main sur une prophétie. En 2001, un traître infiltré au sein de l'équipe des Langue de Plomb avait précédé les Insurgés pour leur ouvrir l'accès. Les employés ont donc été surveillés avec une vigueur et une méfiance toute particulière : une fois acceptés au sein du Département, ils ont été soumis au même contrat magique de Préservation des Mystères, mais qui ne se contentait plus de leur bloquer la langue en cas de tentative de partage d'informations confidentielles. Désormais, il la consumait tel un feu dévorant et la réduisait en cendres et en sang. Leurs baguettes étaient liées au cercle protecteur qui englobait leur zone de travail, leur offrant un accès à la salle circulaire ouvrant sur les 12 portes des salles secrètes ; les permissions d'accès placées sur les baguettes étaient ajustées par le Directeur du département en fonction des tâches attribuées, si bien que les employés n'avaient accès qu'à une à deux salles à la fois et ne pouvaient obtenir de dossiers ou d'expérimentations liés aux autres pièces. En dehors de l'équipe admise par les protections, tout intrus se voyait frappé d'un maléfice qui drainait l'énergie du corps et rendait les membres inutilisables durant 1h. Par ailleurs, le Petrificus Totalus qui entre alors en action frappait quiconque s'approchait à moins de deux mètres de l'entrée, et une alarme silencieuse était immédiatement déclenchée. Dans l'hypothèse où quelqu'un parviendrait à forcer l'accès, la porte en bois noir se transformait en un panneau métallique infranchissable et les sorts qui s'y heurtaient étaient réfléchis en direction du sorcier les ayant formulés.